自然保护地是生态建设的核心载体，截至目前，安徽省已建立自然保护地313个，包括国家级自然保护区和省级自然保护区，涵盖了多种类型，如扬子鳄、升金湖、清凉峰、牯牛降、天马、古井园、鹞落坪、淡水豚等‌。

自然保护地在生物多样性保护、自然遗产保存、生态环境质量改善和生态安全维护方面发挥了重要作用。为了加强自然保护地的管理和保护，安徽省出台《安徽省自然保护区条例》，健全省级层面自然保护地法规制度。完善自然保护地规划，严格自然保护地内建设项目审查审批，加快建设省级智慧平台，推进建设管理标准化体系建设。安徽省年均安排补助资金约8000万元，加强自然保护地能力建设和生态修复。持续开展自然保护地例行排查、省级点位判读核查工作，开发上线自然保护地遥感点位线上审核系统，每年完成两批次点位下发审核，切实加强自然保护地突出生态环境问题监管。